《神医华佗》是一部大投资、大制作的大型剧集，为了把一代神医华佗青年时代传奇浪漫故事表现得更动人，特聘请了台湾亚视的首席导演李翰韬和蒲腾晋执导，又精心挑选以脍炙人口的《苍天有泪》的男女主人公扮演者庹

抗日战争时期，年轻的女考古学家方志珍与父亲方教授同在大学任教，志珍怀着强烈的爱国心决心把失落民间的神医华佗的医著寻找回来。志珍和日本考古学家川多磨在一座古塔中发现两颗明珠，却被也来寻书的德国人干戈